Plavšićeva se 10. januara 2001. godine dobrovoljno predala Haškom sudu pred kojim je 7. aprila 2000. godine optužena za genocid, zločine protiv čovečnosti, ratne zločine nad Bošnjacima i Hrvatima i teške povrede Ženevske konvencije 1991. godine i 1992. godine u BiH.
Na sudu je priznala krivicu za progon nesrpskog stanovništva u BiH kao i za zločin protiv čovečnosti, na osnovu koje je u ferbuaru 2003. godine osuđena na 11 godina zatvora.
