Medvedev je izdao naređenje posle višednevnog bezakonja na obodima glavnog grada Biškeka i otpora koji na jugu zemlje pružaju snage lojalne svrgnutom predsedniku Kurmanbeku Bakijevu.
Pripadnici lokalne ruske i turske etničke zajednice u ponedeljak i utorak bili su meta napada pljačkaša, a u incidentima je poginulo petoro ljudi.
"Predsednik Medvedev izdao je naređenje ministru odbrane Anatoliju Serdjukovu da preduzme mere i osigura bezbednost ruskih građana u Kirgiziji", izjavio je portparol Kremlja.
Rusija ima malu vojnu bazu na severu Kirgistana, sa oko 500 vojnika. SAD koriste vazduhoplovnu bazu u ovoj zemlji, iz koje snabdevaju svoje trupe u Avganistanu.
Privremena Vlada Kirgistana pokušala je da zaustavi nasilje razmeštanjem 300 vojnika i policajaca u predgrađu Biškeka.
Medvedev je ranije tokom dana izjavio da se ta država suočava sa anarhijom i upozorio na moguće regionalne posledice.
"Računamo da će privremena Vlada preduzeti neophodne i dovoljne korake. U protivnom će anarhija naneti veliku štetu narodu Kirgistana i njegovim susedima", naglasio je ruski predsednik.