Penzionisani general je osuđen za zločine protiv čovečnosti i kršenje zakona i običaja rata, zbog zločina nad civilima počinjenim 1994. i 1995. godine, u poslednjim mesecima opsade Sarajeva.
Prvostepena kazna od 33 godine izrečena mu je 12. decembra 2007. godine. Apelaciono veće je podržalo većinu nalaza sudskog veća u Miloševićevom slučaju koji se odnose na artiljerijske napade na civilno stanovništvo u Sarajevu tokom perioda od 15 meseci.
Milošević je, međutim, pravosnažnom presudom oslobođen krivice za napad na buvlju pijacu na Baščaršiji, 22. decembra 1994, zbog nedostatka relevantnih dokaza, kao i za napad na zgradu BITAS-a 22. avgusta i pijace Merkale 28. avgusta 1995. godine, zbog toga što je utvrđeno da je optuženi tada bio na lečenju u Beogradu.
Nekadašnji komandant Sarajevsko-romanijskog korpusa Vojske Republike Srpske predao se 3. decembra 2004. godine sudu u Hagu. Sudski proces protiv njega počeo je u januaru 2007., a prvostepeni posrupak okončan je oktobra iste godine.