Tačan broj poginulih nikada nije utvrđen, a među njima su bila i dva železničara. Pretpostavlja se da je u napadu poginulo najmanje 14 civila, a 16 ranjeno.
Na spomenik žrtvama, stradalim u putničkom vozu broj 393 12. aprila 1999. godine, vence će položiti članovi porodica, predstavnici "Železanice Srbije", gradske uprave Leskovca, političkih stranaka, sindikata i udruženja, saopštile su "Železnice Srbije".
